1.  1980年榮獲沙烏地阿拉伯王國致贈最高榮譽金袍獎
2.  1980年榮獲中國醫藥學院前故院長鄭通和先生頒予「母校之光」、「榮譽校友獎」獎章
3.  1982年榮獲國科會三軍總醫院針灸研究會頒予「功在針灸」獎牌
4.  1983年榮登中國名人傳記中心「中華民國現代名人錄」
5.  1985年榮獲在美國洛杉磯舉行世界中華醫藥學術大會推舉 1985年最傑出針灸醫師並獲美國參、眾兩院之表揚,及洛杉磯市長頒發美國榮譽公民證
6.  1987年膺選中華民國第一屆十大傑出醫師獎,榮獲陳資政立夫先生頒予獎狀及獎牌
7.  1988年省中醫師公會表揚為「中醫楷模」,榮獲陳寬毅理事長頒予「中醫楷模」獎狀及獎牌
8.  1989年榮登美國歷史保留協會世界名人錄
9.  1990年榮獲中美洲薩爾瓦多共和國總統克里斯第雅尼頒贈學術貢獻獎
10. 1990年榮獲中醫師公會全國聯合會張正懋理事長頒予「榮譽狀」獎牌
11. 1990年榮獲全美國針灸與東方醫學學會合辦的針灸暨傳統醫學會,頒發1990年學會主席獎
12. 1991年榮獲英國劍橋國際傳記中心「國際學人名人錄」

13. 1991年以第一名成績畢業於中醫博士班,因學業優良陳資政立夫及陳梅生院長特頒獎牌以資鼓勵
14. 1993年李登輝總統兼文化總會會長頒發狀,以資鼓勵對發揚傳統中醫藥之貢獻卓著
15. 美國布希總統贈送親筆簽名照片,鼓勵林昭庚教授對傳統 中醫藥之貢獻
16. 1993年經全國各界評審膺選為1993年好人好事代表,榮獲李元簇副總統頒發獎狀與獎杯,以資鼓勵其懸壺濟世,為善助人之善行
17. 1994年中國中醫研究院所舉辦之中醫藥學術著作與論獎,榮獲「醫聖杯」之最崇高的「一等獎」、和二個「三等獎」,是大陸以外中國人唯一獲獎者
18. 1994年中華民國中醫師公會全國聯合會理事長巫水生先生頒贈銀盾「醫學堪崇」獎牌及獎狀,以資鼓勵對傳統中醫藥之傑出貢獻
19. 1995年巴布亞新幾內亞國父蘇馬利先生,贈予該國錢幣給林昭庚教授,錢幣上有其親筆簽名及該國父之相片
20. 1997年榮獲國際自然療法傑出人物獎
21. 1992年榮獲國科會甲類優秀獎助
22. 1999年1月榮獲當代世界傳統醫學杰出人物

23. 1999年3月榮獲立夫中醫藥學術著作獎
24. 1999年9月榮獲中國醫藥學院董事會頒贈「傑出校友獎」
25. 2000年經美國帕克萊國際華人事務研究中心審議通過,獲選登錄「2000年跨世紀全球
華人醫學菁英錄」。
26. 2003年陳水扁總統題頒「功著杏林」匾額一方,以資鼓勵對發揚傳統中醫藥之貢獻卓
著(中華民國九十二年七月十一日華總二榮字第○九二○○一二○六七○號,總統府
公報第6534期)