歷史沿革
　　民國73年，本校為宏揚中醫學術、 因應衛生署中醫師人力供給規劃、落實中醫教育、提昇臨床中醫師人力素質，由前故陳董事長立夫先生、郭前院長榮趙等人經兩年的努力而創設本系。成立之初，每屆招收五十名學生，由中醫學系主任兼任學士後中醫學系主任。民國81年開始招收一百名學生，民國83年8月行政相關事務從中醫學系獨立。民國92年8月本校改制大學，本學系歸屬於中醫學院。

目標理念
　　中國傳統醫學薪傳歷經數千年，它有獨立的理論體系與豐富的治療方藥及臨床驗證，一直受到國內外的重視與肯定，為了 傳承中醫、擴大中醫學術研究領域，本學系以培育符合現代需求的中醫師為宗旨。

發展特色
　　國內第一個招收大學各系所畢業生，專注孕育現代中醫師的科系，是融合各種領域知識與現代中醫學於一爐，促進中國醫學多元化發展，以傳承中國醫學對人類醫療保健的薪火。